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Als Schaufenster der Universität Zürich trägt das Zoologische Museum mit seiner Dauerausstellung, den Sonderausstellungen, zahlreichen Veranstaltungen und Angeboten – auch für Schulen und Gruppen – zur Information und zur selbständigen Meinungsbildung in der Öffentlichkeit bei. Dabei weckt es das Bewusstsein und die Begeisterung für die Schönheit, die Vielfalt und den Wert der Natur.
Das Museum ist Teil der Mathematisch-naturwissenschaftlichen Fakultät.